克隆人99号小队继续逃亡，但他们发现帝国的追捕目标不是他们，是他们的DNA。
帝国统治日益严苛，猎人和他的异等小队带着克隆人女孩欧米茄在宇宙边缘逃亡。在一次补给行动中，他们中了帝国圈套，全员被捕。在死牢中，他们见到了帝国首席科学家赫姆洛克。赫姆洛克坦白：他并不在意这几个叛变的克隆人，他想要的是他们体内的突变基因。帝国正在秘密制造一支拥有特殊能力的“异等军队”，而欧米茄的完美DNA是最后一把钥匙。面对即将被批量“复制”的命运，小队必须做出牺牲：让欧米茄逃走，还是全体留下来殊死一战？
粉丝向作品，但情感浓度极高。这一季着重刻画“家庭”这一主题，猎人的领袖担当和欧米茄的成长线都非常动人。战斗场面依然是电影级别，爽快且悲壮。
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一群问题高中生想打篮球争霸赛，却发现教练是个只会纸上谈兵的废柴。
中世纪被烧死的最后一位魔女转世成为现代检察官，她用法力审判那些逃脱法律制裁的恶人，却因此成为被告。
一座百年影院拆除当晚，历任放映员的幽灵齐聚，为最后一个孤独的观众放一场永不散场的告别电影。
新婚之夜，丈夫收到一封匿名信，信上说：你们的爱情只能存活一晚，天亮前你必须找出妻子真正爱的人是谁。
小镇青年阿郎在北京送外卖，只为给妹妹凑学费，却错失了见母亲最后一面。
婚礼前夜，因为突然加价的彩礼，新郎联合前任策划了一场荒唐的逃婚闹剧。